Факторы, влияющие на развитие кишечной микробиоты младенцев

Микробиота кишечника представляет собой сложное биоразнообразие микроорганизмов, включающее множество различных видов, которые колонизируют кишечный тракт человека. Развитие и становление микробиоты кишечника у младенцев подвержены изменениям на протяжении времени в результате воздействия множества факторов. Как считалось ранее, колонизация кишечника младенца микроорганизмами начинается непосредственно после рождения, однако растущий объем данных свидетельствует о том, что внутриутробная среда не стерильна, а передача микробиоты от матери к плоду происходит еще во время беременности. Множество пренатальных факторов способны модулировать состав и развитие кишечной микробиоты младенца, такие как особенности рациона питания матери, наличие у нее ожирения, табакокурение, а также применение антибактериальных препаратов в период гестации. Способ родоразрешения и вид вскармливания являются основополагающими факторами для последующего развития и становления микробиоты у младенца при рождении и послеродовом периоде соответственно. Цель данного обзора – на основе обобщения литературных данных выявить и проанализировать наиболее значимые модифицируемые факторы (питание матери, способ родоразрешения, тип вскармливания), определяющие становление кишечной микробиоты младенца. Такой обзор необходим для создания теоретической базы, которая в дальнейшем может быть использована врачами (неонатологами, педиатрами) для разработки практических мер по оптимизации и коррекции микробиоценоза, профилактики заболеваний, связанных с его нарушением (аллергия, ожирение, сахарный диабет, некрозирующий язвенный колит).

1. Maciel-Fiuza M.F., Muller G.C., Campos D.M.S., Peruzzo J., Bonamigo R.R., Veit T. Role of gut microbiota in infectious and inflammatory diseases. Front. Microbiol. 2023;14:1098386. doi: 10.3389/fmicb.2023.1098386

2. Vandenplas Y., Carnielli V.P., Ksiazyk J., Luna M.S., Migacheva N., Mosselmans J.M., Picaud J.C., Possner M., Singhal A., Wabitsch M. Factors affecting early-life intestinal microbiota development. Nutrition. 2020;78:110812. doi: 10.1016/j.nut.2020.110812

3. Banchi P., Colitti B., Opsomer G., Rota A., van Soom A. The dogma of the sterile uterus revisited: does microbial seeding occur during fetal life in humans and animals? Reproduction. 2023;167(1):e230078. doi: 10.1530/REP-23-0078

4. Blaser M.J., Devkota S., McCoy K.D., Relman D.A., Yassour M., Young V.B. Lessons learned from the prenatal microbiome controversy. Microbiome. 2021;9(1):8. doi: 10.1186/s40168-020-00946-2

5. Кайбышева В.О., Жарова М.Е., Филимендикова К.Ю., Никонов Е.Л. Микробиом человека: возрастные изменения и функции. Доказат. гастроэнтерология. 2020;9(2):42–55. doi: 10.17116/dokgastro2020902142

6. Kaczynska A., Klosinska M., Chmiel P., Janeczek K., Emeryk A. The crosstalk between the gut microbiota composition and the clinical course of allergic rhinitis: the use of probiotics, prebiotics and bacterial lysates in the treatment of allergic rhinitis. Nutrients. 2022;14(20):4328. doi: 10.3390/nu14204328

7. Hou J., Xiang J., Li D., Liu X., Pan W. Gut microbial response to host metabolic phenotypes. Front. Nutr. 2022;9:1019430. doi: 10.3389/fnut.2022.1019430

8. Lundgren S.N., Madan J.C., Emond J.A., Morrison H.G., Christensen B.C., Karagas M.R., Hoen A.G. Maternal diet during pregnancy is related with the infant stool microbiome in a delivery mode-dependent manner. Microbiome. 2018;6(1):109. doi: 10.1186/s40168-018-0490-8

9. Литяева Л.А., Ковалева О.В. Роль питания и кишечной микробиоты беременной женщины в программировании здоровья ребенка. Дет. инфекции. 2017;16(2):40–44. doi: 10.22627/20728107-2017-16-2-40-44

10. Suarez-Martinez C., Santaella-Pascual M., Yague-Guirao G., Martínez-Gracia C. Infant gut microbiota colonization: influence of prenatal and postnatal factors, focusing on diet. Front. Microbiol. 2023;14:1236254. doi: 10.3389/fmicb.2023.1236254

11. Tunay R.T., Tas T.K. Verticle transmission of unique bacterial strains from mother to infant via consuming natural kefir. International Dairy Journal. 2022;126:105251. doi: 10.1016/j.idairyj.2021.105251

12. Tang M., Marroquin E. The role of the gut microbiome in the intergenerational transmission of the obesity phenotype: A narrative review. Front. Med. (Lausanne). 2022;9:1057424. doi: 10.3389/fmed.2022.1057424

13. Robinson A., Fiechtner L., Roche B., Ajami N.J., Petrosino J.F., Camargo C.A. Jr., Taveras E.M., Hasegawa K. Association of maternal gestational weight gain with the infant fecal microbiota. J. Pediatr. Gastroenterol. Nutr. 2017;65(5):509–515. doi: 10.1097/MPG.0000000000001566

14. Raspini B., Porri D., de Giuseppe R., Chieppa M., Liso M., Cerbo R.M., Civardi E., Garofoli F., Monti M.C., Vacca M., De Angelis M., Cena H. Prenatal and postnatal determinants in shaping offspring’s microbiome in the first 1000 days: study protocol and preliminary results at one month of life. Ital. J. Pediatr. 2020;46(1):45. doi: 10.1186/s13052-020-0794-8

15. Singh S.B., Madan J., Coker M., Hoen A., Baker E.R., Karagas M.R., Mueller N.T. Does birth mode modify associations of maternal pre-pregnancy BMI and gestational weight gain with the infant gut microbiome? Int. J. Obes. (Lond.). 2020;44(1):23–32. doi: 10.1038/s41366-018-0273-0

16. Gilley S.P., Ruebel M.L., Sims C., Zhong Y., Turner D., Lan R.S., Pack L.M., Piccolo B.D., Chintapalli S.V., Abraham A., … Shankar K. Associations between maternal obesity and offspring gut microbiome in the first year of life. Ped obesity. 2022;17(9):e12921. doi: 10.1111/ijpo.12921

17. Stanislawski M.A., Dabelea D., Wagner B.D., Sontag M.K., Lozupone C.A., Eggesbo M. Pre-pregnancy weight, gestational weight gain, and the gut microbiota of mothers and their infants. Microbiome. 2017;5(1):113. doi: 10.1186/s40168-017-0332-0

18. Zhang C., Li L., Jin B., Xu X., Zuo X., Li Y., Li Z. The effects of delivery mode on the gut microbiota and health: state of art. Front. Microbiol. 2021;12:724449. doi: 10.3389/fmicb.2021.724449

19. Stewart C.J., Ajami N.J., O’Brien J.L., Hutchinson D.S., Smith D.P., Wong M.C., Ross M.C., Lloyd R.E., Doddapaneni H., Metcalf G.A., … Petrosino J.F. Temporal development of the gut microbiome in early childhood from the TEDDY study. Nature. 2018;562(7728):583–588. doi: 10.1038/s41586-018-0617-x

20. Reddel S., Pascucci G.R., Foligno S., Del Chierico F., Vernocchi P., Marzullo A., Pattumelli M.G., Palma P., Salvatori G., Putignani L. A parallel tracking of salivary and gut microbiota profiles can reveal maturation and interplay of early life microbial communities in healthy infants. Microorganisms. 2022;10(2):468. doi: 10.3390/microorganisms10020468

21. Малыгина О.Г., Бажукова Т.А. Становление микробиоценоза толстой кишки у недоношенных детей с очень низкой и экстремально низкой массой тела на первом году жизни. Ж. микробиол., эпидемиол. и иммунобиол. 2018;95(5):60–66. doi: 10.36233/0372-9311-2018-5-60-66

22. Припутневич Т.В., Исаева Е.Л., Муравьева В.В., Месян М.К., Зубков В.В., Николаева А.В., Бембеева Б.О., Тимофеева Л.А., Козлова А.А., Макаров В.В., Юдин С.М. Становление микробиоты кишечника доношенных и поздних недоношенных детей, рожденных самопроизвольно и путем операции кесарева сечения. Неонатол.: новости, мнения, обуч. 2023;11(1):42–56. doi: 10.33029/23082402-2023-11-1-42-56

23. Программа оптимизации вскармливания детей первого года жизни в Российской Федерации: методические рекомендации. М.: ФГАУ «НМИЦ здоровья детей», 2019. 112 с.

24. Lyons K.E., Ryan C.A., Dempsey E.M., Ross R.P., Stanton C. Breast milk, a source of beneficial microbes and associated benefits for infant health. Nutrients. 2020;12(4):1039. doi: 10.3390/nu12041039

25. Yang S., Cai J., Su Q., Li Q., Meng X. Human milk oligosaccharides combine with Bifidobacterium longum to form the “golden shield” of the infant intestine: metabolic strategies, health effects, and mechanisms of action. Gut Microbes. 2024;16(1):2430418. doi: 10.1080/19490976.2024.2430418

26. Ackerman D.L., Craft K.M., Doster R.S., Weitkamp J.H., Aronoff D.M., Gaddy J.A., Townsend S.D. Antimicrobial and antibiofilm activity of human milk oligosaccharides against Streptococcus agalactiae, Staphylococcus aureus, and Acinetobacter baumannii. ACS. Infect. Dis. 2018;4(3):315–324. doi: 10.1021/acsinfecdis.7b00183

27. Fabiano V., Indrio F., Verduci E., Calcaterra V., Pop T.L., Mari A., Zuccotti G.V., Cullu Cokugras F., Pettoello-Mantovani M., Goulet O. Term infant formulas influencing gut microbiota: an overview. Nutrients. 2021;13(12):4200. doi: 10.3390/nu13124200

28. Differding M.K., Benjamin-Neelon S.E., Hoyo C., Ostbye T., Mueller N.T. Timing of complementary feeding is associated with gut microbiota diversity and composition and short chain fatty acid concentrations over the first year of life. BMC Microbiol. 2020;20(1):56. doi: 10.1186/s12866-020-01723-9

29. Laursen M.F., Bahl M.I., Michaelsen K.F., Licht T.R. First foods and gut microbes. Front. Microbiol. 2017;8:356. doi: 10.3389/fmicb.2017.00356

30. Беляева И.А., Намазова-Баранова Л.С., Бомбардирова Е.П., Шукенбаева Р.A., Турти Т.В. Введение прикорма: «окно возможностей» формирования кишечной микробиоты и модулирования иммунных реакций. Вопр. соврем. педиатрии. 2023;22(6):506–512. doi: 10.15690/vsp.v22i6.2663

31. Sanyang B., Dabrowska M.B., Amenyogbe N., Camara B., Beloum N., Jammeh M., Bojang D., Goodall J., Mohammed N., Sesay A.K., Roca A., de Silva T.I. Effect of intrapartum azithromycin on early childhood gut mycobiota development: post hoc analysis of a double-blind randomized trial. Nat. Commun. 2025;16(1):7356. doi: 10.1038/s41467-025-62142-w

32. Sanyang B., de Silva T.I., Camara B., Beloum N., Kanteh A., Manneh J., de Steenhuijsen Piters W.A.A., Bogaert D., Sesay A.K., Roca A. Effect of intrapartum azithromycin on gut microbiota development in early childhood: A post hoc analysis of a double-blind randomized trial. iScience. 2024;27(9):110626. doi: 10.1016/j.isci.2024.110626

33. Sinha T., Prins J.R., Fernández-Pato A., Kruk M., Dierikx T., de Meij T., de Boer M., de Boer J.F., Scherjon S., Kurilshikov A., Zhernakova A. Maternal antibiotic prophylaxis during cesarean section has a limited impact on the infant gut microbiome. Cell Host Microbe. 2024;32(8):1444–1454.e6. doi: 10.1016/j.chom.2024.07.010

34. Gu H., Tao E., Fan Y., Long G., Jia X., Yuan T., Chen L., Shu X., Zheng W., Jiang M. Effect of β-lactam antibiotics on the gut microbiota of term neonates. Ann. Clin. Microbiol. Antimicrob. 2024;23(1):69. doi: 10.1186/s12941-024-00730-2

35. Iqbal F., Shenoy P.A., Lewis L.E.S., Siva N., Purkayastha J., Eshwara V.K. Influence of perinatal antibiotic on neonatal gut microbiota: a prospective cohort study. BMC Pediatr. 2025;25(1):560. doi: 10.1186/s12887-025-05907-y

36. Ojeda A., Akinsuyi O., McKinley K.L., Xhumari J., Triplett E.W., Neu J., Roesch L.F.W. Increased antibiotic resistance in preterm neonates under early antibiotic use. mSphere. 2024;9(10):e0028624. doi: 10.1128/msphere.00286-24

37. Leo S., Cetiner O.F., Pittet L.F., Messina N.L., Jakob W., Falquet L., Curtis N., Zimmermann P. Metagenomics analysis of the neonatal intestinal resistome. Front. Pediatr. 2023;11:1169651. doi: 10.3389/fped.2023.1169651

38. Jeong S. Factors influencing development of the infant microbiota: from prenatal period to early infancy. Clin. Exp. Pediatr. 2022;65(9):439–447. doi: 10.3345/cep.2021.00955

39. Peng Y., Tun H.M., Ng S.C., Wai H.K., Zhang X., Parks J., Field C.J., Mandhane P., Moraes T.J., Simons E., … Kozyrskyj A.L. Maternal smoking during pregnancy increases the risk of gut microbiome-associated childhood overweight and obesity. Gut Microbes. 2024;16(1):2323234. doi: 10.1080/19490976.2024.2323234

40. Scheible K., Beblavy R., Sohn M.B., Qui X., Gill A.L., Narvaez-Miranda J., Brunner J., Miller R.K., Barrett E.S., O’Connor T.G., Gill S.R. Affective symptoms in pregnancy are associated with the vaginal microbiome. J. Affect. Disord. 2025;368:410–419. doi: 10.1016/j.jad.2024.09.108