Журнал был создан в 1981 году. Названия журнала:
- с 1981 по 1991 год - «Бюллетень Сибирского отделения Академии медицинских наук СССР»;
- с 1992 по 2014 год - «Бюллетень Сибирского отделения Российской академии медицинских наук»;
- с 2015 года - «Сибирский научный медицинский журнал».
