sibmedСибирский научный медицинский журналСибирский научный медицинский журнал2410-25122410-2520ИЦиГ СО РАН10.18699/SSMJ20250425sibmed-2359Research ArticleКЛИНИЧЕСКАЯ МЕДИЦИНАCLINICAL MEDICINEАссоциации полиморфных вариантов гена SLCO1B1 с вирусологической эффективностью у детей с ВИЧ-инфекциейAssociations of SLCO1B1 polymorphism with virological efficacy in children with HIV infectionhttps://orcid.org/0000-0001-5790-6282СамбяловаА. Ю.SambyalovaA. Yu.

Самбялова Александра Юрьевна

664003, г. Иркутск, ул. Тимирязева, 16

Alexandra Yu. Sambyalova

664003, Irkutsk, Timiryazeva st., 16

sambialova95@mail.ruhttps://orcid.org/0000-0003-3704-830XБаироваТ. А.BairovaT. A.

Баирова Татьяна Ананьевна, д.м.н.

664003, г. Иркутск, ул. Тимирязева, 16

Tatyana A. Bairova, doctor of medical sciences

664003, Irkutsk, Timiryazeva st., 16

tbairova38@mail.ruhttps://orcid.org/0000-0001-9201-7288ЕлецкаяТ. Л.EletskayaT. L.

Елецкая Татьяна Леонидовна

664003, г. Иркутск, ул. Тимирязева, 16,

664035, г. Иркутск, ул. Cпартаковская, 11

Tatiana L. Eletskaya

664003, Irkutsk, Timiryazeva st., 16,

664035, Irkutsk, Spartakovskaya st., 11

vodnay.stihiay@gmail.comhttps://orcid.org/0000-0003-3678-7274БельскихА. В.BelskikhA. V.

Бельских Алексей Владимирович, к.х.н.

664003, г. Иркутск, ул. Тимирязева, 16

Aleksei V. Belskikh, candidate of chemical sciences

664003, Irkutsk, Timiryazeva st., 16

alex590750@yandex.ruhttps://orcid.org/0000-0001-6050-5287БеляеваЕ. В.BelyaevaE. V.

Беляева Елена Владимировна, к.б.н.

664003, г. Иркутск, ул. Тимирязева, 16

Elena V. Belyaeva, candidate of biological sciences

664003, Irkutsk, Timiryazeva st., 16

belyeva_irk@mail.ruhttps://orcid.org/0000-0003-0690-4636ЕршоваО. А.ErshovaO. A.

Ершова Оксана Александровна, к.б.н.

664003, г. Иркутск, ул. Тимирязева, 16

Oksana A. Ershova, candidate of biological sciences

664003, Irkutsk, Timiryazeva st., 16

oksana111088@mail.ruhttps://orcid.org/0000-0002-9720-8750НемчиноваН. В.NemchinovaN. V.

Немчинова Надежда Владимировна

664003, г. Иркутск, ул. Тимирязева, 16

Nadezhda V. Nemchinova

664003, Irkutsk, Timiryazeva st., 16

nemchinova.nad@gmail.comhttps://orcid.org/0000-0003-3396-9590СиньковВ. В.SinkovV. V.

Синьков Вячеслав Владимирович, к.м.н.

664003, г. Иркутск, ул. Тимирязева, 16

Viacheslav V. Sinkov, candidate of medical sciences

664003, Irkutsk, Timiryazeva st., 16

vsinkov@gmail.comhttps://orcid.org/0000-0003-2912-9118ПлотниковаЮ. К.PlotnikovaYu. K.

Плотникова Юлия Кимовна, к.м.н.

664035, г. Иркутск, ул. Cпартаковская, 11

Yulia K. Plotnikova, candidate of medical sciences

664035, Irkutsk, Spartakovskaya st., 11

aids@aids38.ruhttps://orcid.org/0000-0003-2910-0737РычковаЛ. В.RychkovaL. V.

Рычкова Любовь Владимировна, д.м.н., проф., чл.-корр. РАН

664003, г. Иркутск, ул. Тимирязева, 16

Lyubov V. Rychkova, doctor of medical sciences, professor of RAS

664003, Irkutsk, Timiryazeva st., 16

iphr@sbamsr.irk.ruНаучный центр проблем здоровья семьи и репродукции человекаРоссияScientific Сentre for Family Health and Human Reproduction ProblemsRussian FederationНаучный центр проблем здоровья семьи и репродукции человека; Иркутский областной центр по профилактике и борьбе со СПИД и инфекционными заболеваниямиРоссияScientific Сentre for Family Health and Human Reproduction Problems; Irkutsk Regional AIDS CentreRussian FederationИркутский областной центр по профилактике и борьбе со СПИД и инфекционными заболеваниямиРоссияIrkutsk Regional AIDS CentreRussian Federation202505092025454235243Copyright © Самбялова А.Ю., Баирова Т.А., Елецкая Т.Л., Бельских А.В., Беляева Е.В., Ершова О.А., Немчинова Н.В., Синьков В.В., Плотникова Ю.К., Рычкова Л.В., 20252025Самбялова А.Ю., Баирова Т.А., Елецкая Т.Л., Бельских А.В., Беляева Е.В., Ершова О.А., Немчинова Н.В., Синьков В.В., Плотникова Ю.К., Рычкова Л.В.Sambyalova A.Y., Bairova T.A., Eletskaya T.L., Belskikh A.V., Belyaeva E.V., Ershova O.A., Nemchinova N.V., Sinkov V.V., Plotnikova Y.K., Rychkova L.V.This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 License.https://sibmed.elpub.ru/jour/article/view/2359

Цель исследования – выявить связь между полиморфными вариантами гена SLCO1B1 и вирусологической эффективностью у детей, принимающих лопинавир в схеме антиретровирусной терапии.

Материал и методы

Материал и методы. В исследование включено 48 детей с ВИЧ-инфекцией в возрасте от 4 до 17 лет, получающих лопинавир в схеме антиретровирусной терапии. Первая группа – 32 пациента с вирусологической эффективностью, дети с неопределяемой вирусной нагрузкой <50 копий/мл, вторая группа – 16 пациентов без вирусологической эффективности, дети с определяемой вирусной нагрузкой >50 копий/мл. Библиотеки готовили в соответствии с протоколом DNA Flex, следуя рекомендациям производителя (Illumina, США). Секвенирование проводили на платформе NextSeq 550.

Результаты

Результаты. При таргетном секвенировании участка гена SLCO1B1 выявлено 37 полиморфных вариантов. При анализе выявленных полиморфных вариантов установлено, что rs4149056 гена SLCO1B1 ассоциирован с вирусологической эффективностью у детей с ВИЧ-инфекцией. Носительство генотипов ТС/СС полиморфного варианта rs4149056 зарегистрировано чаще в группе с вирусологической эффективностью, чем без нее (отношение шансов 0,14, 95%-й доверительный интервал 0,01–0,812, p = 0,017).

Заключение

Заключение. Носительство генотипов ТС/СС полиморфизма rs4149056 может служить предиктором вирусологической эффективности у детей с ВИЧинфекцией, получающих терапию лопинавиром в схеме комбинированной антиретровирусной терапии.

The aim of the study was to identify the association between polymorphism of the SLCO1B1 gene and virological efficacy in children receiving lopinavir as part of their antiretroviral therapy.

Material and methods

Material and methods. The study included 48 children with HIV infection aged 4 to 17 years receiving lopinavir as part of their antiretroviral therapy. The first group of 32 patients with virological efficacy included children with undetectable viral load <50 copies/ml, the second group of 16 patients without virological efficacy included children with detectable viral load >50 copies/ml. The libraries were prepared according to the DNA Flex protocol, following the manufacturer’s recommendations (Illumina, USA). Sequencing was performed on the NextSeq 550 platform.

Results

Results. Targeted sequencing of the SLCO1B1 gene region revealed 37 polymorphisms. Analysis of the identified polymorphisms showed that rs4149056 of the SLCO1B1 gene is associated with virological efficacy in children with HIV infection. The carriage of TC/CC genotypes of the rs4149056 polymorphism was registered more often in the group with virological efficacy than without it (odds ratio 0.14, 95% confidence interval 0.01–0.812, p = 0.017).

Conclusions

Conclusions. The carriage of TC/CC genotypes of the rs4149056 polymorphism may serve as a predictor of virological efficacy in children with HIV infection receiving lopinavir therapy in combination antiretroviral therapy.

ген SLCO1B1органические анион-транспортирующие полипептидыrs4149056ВИЧинфекцияполиморфные вариантылопинавирдетиgene SLCO1B1organic anion-transporting polypeptidesrs4149056HIV infectionpolymorphismslopinavirchildrenReferencesHagenbuch B., Meier P.J. Organic anion transporting polypeptides of the OATP/ SLC21 family: phylogenetic classification as OATP/SLCO superfamily, new nomenclature and molecular/functional properties. Pflugers Arch. 2004;447(5):653–665. doi: 10.1007/s00424-003-1168-yHagenbuch B., Meier P.J. Organic anion transporting polypeptides of the OATP/ SLC21 family: phylogenetic classification as OATP/SLCO superfamily, new nomenclature and molecular/functional properties. Pflugers Arch. 2004;447(5):653–665. doi: 10.1007/s00424-003-1168-yDragović G., Dimitrijević B., Kušić J., Soldatović I., Jevtović D., Olagunju A., Owen A. Influence of SLCO1B1 polymorphisms on lopinavir C trough in Serbian HIV/AIDS patients. Br. J. Clin. Pharmacol. 2020;86(7):1289–1295. doi: 10.1111/bcp.14230Dragović G., Dimitrijević B., Kušić J., Soldatović I., Jevtović D., Olagunju A., Owen A. Influence of SLCO1B1 polymorphisms on lopinavir C trough in Serbian HIV/AIDS patients. Br. J. Clin. Pharmacol. 2020;86(7):1289–1295. doi: 10.1111/bcp.14230Mo Q., Huang S., Ma J., Zhang J., Su R., Deng Q. Association between SLCO1B1 polymorphism distribution frequency and blood lipid level in Chinese adults. Br. J. Biomed. Sci. 2021;78(1):23–27. doi: 10.1080/09674845.2020.1785692Mo Q., Huang S., Ma J., Zhang J., Su R., Deng Q. Association between SLCO1B1 polymorphism distribution frequency and blood lipid level in Chinese adults. Br. J. Biomed. Sci. 2021;78(1):23–27. doi: 10.1080/09674845.2020.1785692Wu Y., Fang F., Wang Z., Wen P., Fan J. The influence of recipient SLCO1B1 rs2291075 polymorphism on tacrolimus dose-corrected trough concentration in the early period after liver transplantation. Eur. J. Clin. Pharmacol. 2021;77(6):859–867. doi: 10.1007/s00228-020-03058-wWu Y., Fang F., Wang Z., Wen P., Fan J. The influence of recipient SLCO1B1 rs2291075 polymorphism on tacrolimus dose-corrected trough concentration in the early period after liver transplantation. Eur. J. Clin. Pharmacol. 2021;77(6):859–867. doi: 10.1007/s00228-020-03058-wНациональная ассоциация специалистов по профилактике, диагностике и лечению ВИЧинфекции. Клинические рекомендации «ВИЧинфекция у детей», 2024. Режим доступа: clck.ru/3MyFA5National Association of Specialists in Prevention, Diagnosis and Treatment of HIV Infection. Clinical Guidelines “HIV Infection in Children”. 2024. Available at: clck.ru/3MyFA5 [In Russian].Sigaloff K.C., Calis J.C., Geelen S.P., van Vugt M., de Wit T.F. HIV-1-resistance-associated mutations after failure of first-line antiretroviral treatment among children in resource-poor regions: a systematic review. Lancet Infect. Dis. 2011;11(10):769–779. doi: 10.1016/S1473-3099(11)70141-4Sigaloff K.C., Calis J.C., Geelen S.P., van Vugt M., de Wit T.F. HIV-1-resistance-associated mutations after failure of first-line antiretroviral treatment among children in resource-poor regions: a systematic review. Lancet Infect. Dis. 2011;11(10):769–779. doi: 10.1016/S1473-3099(11)70141-4Zhao Y., Mu W., Harwell J., Zhou H., Sun X., Cheng Y., Li C., Zhang F. Drug resistance profiles among HIV-1-infected children experiencing delayed switch and 12-month efficacy after using second-line antiretroviral therapy: an observational cohort study in rural China. J. Acquir. Immune Defic. Syndr. 2011;58(1):47– 53. doi: 10.1097/QAI.0b013e318229f2a2Zhao Y., Mu W., Harwell J., Zhou H., Sun X., Cheng Y., Li C., Zhang F. Drug resistance profiles among HIV-1-infected children experiencing delayed switch and 12-month efficacy after using second-line antiretroviral therapy: an observational cohort study in rural China. J. Acquir. Immune Defic. Syndr. 2011;58(1):47– 53. doi: 10.1097/QAI.0b013e318229f2a2Waalewijn H., Turkova A., Rakhmanina N., Cressey T.R., Penazzato M., Colbers A., Burger D.M.; Pediatric Antiretroviral Working Group (PAWG). Optimizing pediatric dosing recommendations and treatment management of antiretroviral drugs using therapeutic drug monitoring data in children living with HIV. Ther. Drug Monit. 2019;41(4):431–443. doi: 10.1097/FTD.0000000000000637Waalewijn H., Turkova A., Rakhmanina N., Cressey T.R., Penazzato M., Colbers A., Burger D.M.; Pediatric Antiretroviral Working Group (PAWG). Optimizing pediatric dosing recommendations and treatment management of antiretroviral drugs using therapeutic drug monitoring data in children living with HIV. Ther. Drug Monit. 2019;41(4):431–443. doi: 10.1097/FTD.0000000000000637Самбялова А.Ю., Баирова Т.А., Манаенкова Т.Л., Рычкова Л.В. Роль фармакогенетики в безопасности и эффективности терапии ингибиторами протеаз ВИЧ инфицированных пациентов. Acta Biomed. Sci. 2021;6(6-2):113–124. doi: 10.29413/ABS.2021-6.6-2.12Sambyalova A.Yu., Bairova T.A., Manaenkova T.L., Rychkova L.V. The role of pharmacogenetics in efficacy and safety of protease inhibitor based therapy in human immunodeficiency virus type (HIV) infection. Acta Biomed. Sci. 2021;6(6-2):113–124. [In Russian]. doi: 10.29413/ABS.2021-6.6-2.12Самбялова А.Ю., Баирова Т.А., Бельских А.В., Манаенкова Т.Л., Беляева Е.В., Ершова О.А., Немчинова Н.В., Плотникова Ю.К., Колесникова Л.И., Рычкова Л.В. Лекарственный мониторинг антиретровирусных препаратов у детей с перинатальной ВИЧ-инфекцией. Acta Biomed. Sci. 2024;9(3):102–110. doi: 10.29413/ABS.2024-9.3.10Sambyalova A.Yu., Bairova T.A., Belskikh A.V., Manaenkova T.L., Belyaeva E.V., Ershova O.A., Nemchinova N.V., Plotnikova Yu.K., Kolesnikova L.I., Rychkova L.V. Drug monitoring of antiretroviral drugs in children with perinatal HIV infection. Acta Biomed. Sci. 2024;9(3):102-110. [In Russian]. doi: 10.29413/ABS.2024-9.3.10Самбялова А.Ю., Баирова Т.А., Манаенкова Т.Л., Бельских А.В., Беляева Е.В., Ершова О.А., Кумратов Д.В., Парамонов А.И., Плотникова Ю.К., Коломеец Л.В., Рычкова Л.В. Некоторые фармакогенетические аспекты гена ABCB1 в вариативности концентрации лопинавира / ритонавира у детей с ВИЧ-инфекцией: пилотное исследование. Acta Biomed. Sci. 2022;7(5-1):53–61. doi: 10.29413/ABS.2022-7.5-1.7Sambyalova A.Yu., Bairova T.A., Manaenkova T.L., Belskikh A.V., Belyaeva E.V., Ershova O.A., Kumratov D.V., Paramonov A.I., Plotnikova Yu.K., Kolomeets L.V., Rychkova L.V. Some pharmacogenetic aspects of the ABCB1 gene in lopinavir / ritonavir concentration variability in children with HIV infection: A pilot study. Acta Biomed. Sci. 2022;7(5-1):53–61. [In Russian]. doi: 10.29413/ABS.2022-7.5-1.7Crommentuyn K.M., Kappelhoff B.S., Mulder J.W., Mairuhu A.T., van Gorp E.C., Meenhorst P.L., Huitema A.D., Beijnen J.H. Population pharmacokinetics of lopinavir in combination with ritonavir in HIV-1-infected patients. Br. J. Clin. Pharmacol. 2005;60(4):378–389. doi: 10.1111/j.1365-2125.2005.02455.xCrommentuyn K.M., Kappelhoff B.S., Mulder J.W., Mairuhu A.T., van Gorp E.C., Meenhorst P.L., Huitema A.D., Beijnen J.H. Population pharmacokinetics of lopinavir in combination with ritonavir in HIV-1-infected patients. Br. J. Clin. Pharmacol. 2005;60(4):378–389. doi: 10.1111/j.1365-2125.2005.02455.xKullak-Ublick G.A., Hagenbuch B., Stieger B., Schteingart C.D., Hofmann A.F., Wolkoff A.W., Meier P.J. Molecular and functional characterization of an organic anion transporting polypeptide cloned from human liver. Gastroenterology. 1995;109(4):1274–1282. doi: 10.1016/0016-5085(95)90588-xKullak-Ublick G.A., Hagenbuch B., Stieger B., Schteingart C.D., Hofmann A.F., Wolkoff A.W., Meier P.J. Molecular and functional characterization of an organic anion transporting polypeptide cloned from human liver. Gastroenterology. 1995;109(4):1274–1282. doi: 10.1016/0016-5085(95)90588-xRoszkiewicz J., Michałek D., Ryk A., Swacha Z., Szmyd B., Smolewska E. SLCO1B1 variants as predictors of methotrexate-related toxicity in children with juvenile idiopathic arthritis. Scand. J. Rheumatol. 2021;50(3):213–217. doi: 10.1080/03009742.2020.1818821Roszkiewicz J., Michałek D., Ryk A., Swacha Z., Szmyd B., Smolewska E. SLCO1B1 variants as predictors of methotrexate-related toxicity in children with juvenile idiopathic arthritis. Scand. J. Rheumatol. 2021;50(3):213–217. doi: 10.1080/03009742.2020.1818821Niemi M., Pasanen M.K., Neuvonen P.J. Organic anion transporting polypeptide 1B1: a genetically polymorphic transporter of major importance for hepatic drug uptake. Pharmacol. Rev. 2011;63(1):157–181. doi: 10.1124/pr.110.002857Niemi M., Pasanen M.K., Neuvonen P.J. Organic anion transporting polypeptide 1B1: a genetically polymorphic transporter of major importance for hepatic drug uptake. Pharmacol. Rev. 2011;63(1):157–181. doi: 10.1124/pr.110.002857Tirona R.G., Leake B.F., Merino G., Kim R.B. Polymorphisms in OATP-C: identification of multiple allelic variants associated with altered transport activity among European-and African-Americans. J. Biol. Chem. 2001;276(38):35669–35675. doi: 10.1074/jbc.M103792200Tirona R.G., Leake B.F., Merino G., Kim R.B. Polymorphisms in OATP-C: identification of multiple allelic variants associated with altered transport activity among European-and African-Americans. J. Biol. Chem. 2001;276(38):35669–35675. doi: 10.1074/jbc.M103792200Pasanen M.K., Neuvonen P.J., Niemi M. Global analysis of genetic variation in SLCO1B1. Pharmacogenomics. 2008;9(1):19–33. doi: 10.2217/14622416.9.1.19Pasanen M.K., Neuvonen P.J., Niemi M. Global analysis of genetic variation in SLCO1B1. Pharmacogenomics. 2008;9(1):19–33. doi: 10.2217/14622416.9.1.19National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine. Available at: clck.ru/3MyHNANational Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine. Available at: clck.ru/3MyHNALiu X., Ma Q., Zhao Y., Mu W., Sun X., Cheng Y., Zhang H., Ma Y., Zhang F. Impact of single nucleotide polymorphisms on plasma concentrations of efavirenz and lopinavir/ritonavir in Chinese children infected with the human immunodeficiency virus. Pharmacotherapy. 2017;37(9):1073–1080. doi: 10.1002/phar.1988Liu X., Ma Q., Zhao Y., Mu W., Sun X., Cheng Y., Zhang H., Ma Y., Zhang F. Impact of single nucleotide polymorphisms on plasma concentrations of efavirenz and lopinavir/ritonavir in Chinese children infected with the human immunodeficiency virus. Pharmacotherapy. 2017;37(9):1073–1080. doi: 10.1002/phar.1988Rakhmanina N.Y., Neely M.N., van Schaik R.H., Gordish-Dressman H.A., Williams K.D., Soldin S.J., van den Anker J.N. CYP3A5, ABCB1, and SLCO1B1 polymorphisms and pharmacokinetics and virologic outcome of lopinavir/ritonavir in HIV-infected children. Ther. Drug Monit. 2011;33(4):417–424. doi: 10.1097/FTD.0b013e318225384fRakhmanina N.Y., Neely M.N., van Schaik R.H., Gordish-Dressman H.A., Williams K.D., Soldin S.J., van den Anker J.N. CYP3A5, ABCB1, and SLCO1B1 polymorphisms and pharmacokinetics and virologic outcome of lopinavir/ritonavir in HIV-infected children. Ther. Drug Monit. 2011;33(4):417–424. doi: 10.1097/FTD.0b013e318225384fGlass T.R., Rotger M., Telenti A., Decosterd L., Csajka C., Bucher H.C., Günthard H.F., Rickenbach M., Nicca D., Hirschel B., … Swiss HIV Cohort Study. Determinants of sustained viral suppression in HIV-infected patients with self-reported poor adherence to antiretroviral therapy. PLoS One. 2012;7(1):e29186. doi: 10.1371/journal.pone.0029186Glass T.R., Rotger M., Telenti A., Decosterd L., Csajka C., Bucher H.C., Günthard H.F., Rickenbach M., Nicca D., Hirschel B., … Swiss HIV Cohort Study. Determinants of sustained viral suppression in HIV-infected patients with self-reported poor adherence to antiretroviral therapy. PLoS One. 2012;7(1):e29186. doi: 10.1371/journal.pone.0029186Lehtisalo M., Taskinen S., Tarkiainen E.K., Neuvonen M., Viinamäki J., Paile-Hyvärinen M., Lilius T.O., Tapaninen T., Backman J.T., Tornio A., Niemi M. A comprehensive pharmacogenomic study indicates roles for SLCO1B1, ABCG2 and SLCO2B1 in rosuvastatin pharmacokinetics. Br. J. Clin. Pharmacol. 2023;89(1):242–252. doi: 10.1111/bcp.15485Lehtisalo M., Taskinen S., Tarkiainen E.K., Neuvonen M., Viinamäki J., Paile-Hyvärinen M., Lilius T.O., Tapaninen T., Backman J.T., Tornio A., Niemi M. A comprehensive pharmacogenomic study indicates roles for SLCO1B1, ABCG2 and SLCO2B1 in rosuvastatin pharmacokinetics. Br. J. Clin. Pharmacol. 2023;89(1):242–252. doi: 10.1111/bcp.15485Phan L., Jin Y., Zhang H., Qiang W., Shekhtman E., Shao D., Revoe D., Villamarin R., Ivanchenko E., Kimura M., … Kattman B.L. “ALFA: Allele Frequency Aggregator”. National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine, 10 Mar. 2020. Available at: clck.ru/3MyHepPhan L., Jin Y., Zhang H., Qiang W., Shekhtman E., Shao D., Revoe D., Villamarin R., Ivanchenko E., Kimura M., … Kattman B.L. “ALFA: Allele Frequency Aggregator”. National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine, 10 Mar. 2020. Available at: clck.ru/3MyHepNational Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine. Available at: clck.ru/3N6beANational Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine. Available at: clck.ru/3N6beAThe Pharmacogenomics Knowledgebase (PharmGKB). Available at: clck.ru/3MyHrWThe Pharmacogenomics Knowledgebase (PharmGKB). Available at: clck.ru/3MyHrW

The authors declare that there are no conflicts of interest present.