sibmedСибирский научный медицинский журналСибирский научный медицинский журнал2410-25122410-2520ИЦиГ СО РАН10.15372/SSMJ20190204sibmed-130Research ArticleМЕДИКО-БИОЛОГИЧЕСКИЕ НАУКИBIOMEDICINEГЕТЕРОГЕННОСТЬ ПЛАЗМИД МОЛЕКУЛЯРНОЙ МАССОЙ 2,3 МДа В ШТАММАХ Salmonella enteritidisHETEROGENEITY OF 2.3 MDa PLASMIDS IN Salmonella ENTERITIDIS STRAINSРаковА. В.RakovA. V.

к.м.н., старший научный сотрудник

 

candidate of medical sciences, senior researcher

690087, Vladivostok, Sel’skaya str., 1

alexeyrakov@mail.ruШубинФ. Н.ShubinF. N.

д.м.н., проф., главный научный сотрудник

 

doctor of medical sciences, professor, chief researcher

690087, Vladivostok, Sel’skaya str., 1

shubin@inbox.ruКузнецоваН. А.KuznetsovaN. A.

к.м.н., старший научный сотрудник

 

candidate of medical sciences, senior researcher

690087, Vladivostok, Sel’skaya str., 1

kuznetsovanata@mail.ruСоловьеваА. С.SolovyevaA. S.

младший научный сотрудник

 

junior researcher

690087, Vladivostok, Sel’skaya str., 1

dj_svet8525@mail.ruSomov Institute of Epidemiology and MicrobiologyRussian Federation2019290420193924045Copyright © Раков А.В., Шубин Ф.Н., Кузнецова Н.А., Соловьева А.С., 20192019Раков А.В., Шубин Ф.Н., Кузнецова Н.А., Соловьева А.С.Rakov A.V., Shubin F.N., Kuznetsova N.A., Solovyeva A.S.Данная работа распространяется под лицензией Creative Commons Attribution 4.0.This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 License.https://sibmed.elpub.ru/jour/article/view/130

Цель исследования – изучить плазмиды с молекулярной массой 2,3 МДа (3609 пар оснований), а также их распространение в штаммах Salmonella enteritidis, изолированных из различных экологических источников в разное время на территории Российской Федерации. Материал и методы. Выполнено ПЦР-типирование 33 штаммов S. enteritidis, выделенных за период с 1995 по 2017 г., содержащих описанную нами ранее в штаммах микроба плазмиду молекулярной массой 2,3 МДа. Результаты и их обсуждение. Данная плазмида была впервые секвенирована нами. Показано ее родство представленной в GenBank плазмиде из штамма S. typhimurium CFSAN001921, описанной в США. Установлено, что плазмида p2.3 в течение 23 лет присутствует в штаммах S. enteritidis, изолированных от больных и пищевых продуктов на административных территориях большинства субъектов РФ. Кроме того, показано, что плазмида p2.3 может быть гетерогенной по нуклеотидному составу. Заключение. Учитывая, что плазмида p2.3 выделена от больных в США, а исследованные нами штаммы – от больных и из продуктов животного происхождения в России, можно полагать, что ареал распространения данной плазмиды носит трансконтинентальный характер.

The aim of the research was to study plasmids 2.3 MDa (3609 bp) and their distribution in Salmonella Enteritidis strains isolated from various environmental sources at different times on the territory of the Russian Federation. Material and methods. A PCR typing of 33 S. Enteritidis strains, isolated for the period from 1995 to 2017, containing plasmid 2.3 MDa described earlier in microbe strains has been carried out. Results and discussion. The plasmid was firstly sequenced by us. Its relatedness to plasmid in GenBank from the strain of S. Typhimurium CFSAN001921 described in the United States has been revealed. It has been established that plasmid p2.3 presents within 23 years in S. Enteritidis strains isolated from patients and food at administrative territories of majority of the Russian Federation subjects. In addition, it has been shown that plasmid p2.3 can be heterogeneous in nucleotide composition. Conclusion. Considering the fact that plasmid p2.3 was isolated from patients in the USA, and strains we investigated were from patients and food in Russia, it can be assumed that the distribution area of the plasmid has a transcontinental nature.

Salmonella enteritidisплазмида p2.3плазмидный анализполимеразная цепная реакцияSalmonella Enteritidisplasmid p2.3plasmid analysispolymerase chain reactionReferencesГолубева И.В., Килессо В.А., Киселева Б.С., Прямухина Н.С., Татаринова С.Д., Хоменко Н.А., Ющенко Г.В. Энтеробактерии. Руководство для врачей. М.: Медицина, 1985. 320 c.Голубева И.В., Килессо В.А., Киселева Б.С., Прямухина Н.С., Татаринова С.Д., Хоменко Н.А., Ющенко Г.В. Энтеробактерии. Руководство для врачей. М.: Медицина, 1985. 320 c.Кузнецова Н.А., Шубин Ф.Н., Раков А.В., Тарасенко Т.Т., Воронок В.М. Возрастная структура сальмонеллеза, вызванного доминирующими плазмидоварами Salmonella enteritidis, в г. Владивостоке // Тихоокеан. мед. журн. 2006. (3). 80–82.Кузнецова Н.А., Шубин Ф.Н., Раков А.В., Тарасенко Т.Т., Воронок В.М. Возрастная структура сальмонеллеза, вызванного доминирующими плазмидоварами Salmonella enteritidis, в г. Владивостоке // Тихоокеан. мед. журн. 2006. (3). 80–82.Раков А.В. Микробиолого-клинические параллели при сальмонеллезной инфекции: автореф. дис. … канд. мед. наук. Владивосток, 2003.Раков А.В. Микробиолого-клинические параллели при сальмонеллезной инфекции: автореф. дис. … канд. мед. наук. Владивосток, 2003.Раков А.В., Шубин Ф.Н., Кузнецова Н.А. Гетерогенность плазмид молекулярной массой 1,4 МДа в штаммах Salmonella enteritidis // Бюл. СО РАМН. 2013. 33. (2). 10–15.Раков А.В., Шубин Ф.Н., Кузнецова Н.А. Гетерогенность плазмид молекулярной массой 1,4 МДа в штаммах Salmonella enteritidis // Бюл. СО РАМН. 2013. 33. (2). 10–15.Шубин Ф.Н., Ковальчук Н.И., Кузнецова Н.А., Ревина Г.В., Раков А.В., Белоголовкина Н.А., Нечухаева Е.М. Микробиологический мониторинг за Salmonella enteritidis в Приморском крае. Фенотипическая и плазмидная характеристика возбудителя // Эпидемиол. и инфекц. болезни. 2002. (1). 36–40.Шубин Ф.Н., Ковальчук Н.И., Кузнецова Н.А., Ревина Г.В., Раков А.В., Белоголовкина Н.А., Нечухаева Е.М. Микробиологический мониторинг за Salmonella enteritidis в Приморском крае. Фенотипическая и плазмидная характеристика возбудителя // Эпидемиол. и инфекц. болезни. 2002. (1). 36–40.Шубин Ф.Н., Раков А.В., Кузнецова Н.А. Микробиологический молекулярно-генетический мониторинг за возбудителями кишечных инфекций как составная часть эпидемиологического надзора // Бюл. СО РАМН. 2011. (4). 100–106.Шубин Ф.Н., Раков А.В., Кузнецова Н.А. Микробиологический молекулярно-генетический мониторинг за возбудителями кишечных инфекций как составная часть эпидемиологического надзора // Бюл. СО РАМН. 2011. (4). 100–106.Boyd E.F., Hartl D.L. Recent horizontal transmission of plasmids between natural populations of Escherichia coli and Salmonella enterica // J. Bacteriol. 1997. 179. (5). 1622–1627.Boyd E.F., Hartl D.L. Recent horizontal transmission of plasmids between natural populations of Escherichia coli and Salmonella enterica // J. Bacteriol. 1997. 179. (5). 1622–1627.Boyd E.F., Hartl D.L. Salmonella virulence plasmid. Modular acquisition of the spv virulence region by an F-plasmid in Salmonella enterica subspecies I and insertion into the chromosome of subspecies II, IIIa, IV and VII isolates // Genetics. 1998. 149. (3). 1183–1190.Boyd E.F., Hartl D.L. Salmonella virulence plasmid. Modular acquisition of the spv virulence region by an F-plasmid in Salmonella enterica subspecies I and insertion into the chromosome of subspecies II, IIIa, IV and VII isolates // Genetics. 1998. 149. (3). 1183–1190.Chiu C.H., Ou J.T. Rapid identification of Salmonella serovars in feces by specific detection of virulence genes, invA and spvC, by an enrichment broth culture-multiplex PCR combination assay // J. Clin. Microbiol. 1996. 34. (10). 2619–2622.Chiu C.H., Ou J.T. Rapid identification of Salmonella serovars in feces by specific detection of virulence genes, invA and spvC, by an enrichment broth culture-multiplex PCR combination assay // J. Clin. Microbiol. 1996. 34. (10). 2619–2622.Kado C.I., Liu S.T. Rapid procedure for detection and isolation of large and small plasmids // J. Bacteriol. 1981. 145. (3). 1365–1373.Kado C.I., Liu S.T. Rapid procedure for detection and isolation of large and small plasmids // J. Bacteriol. 1981. 145. (3). 1365–1373.Kotetishvili M., Stine O.C., Kreger A., Morris J.G.Jr., Sulakvelidze A. Multilocus sequence typing for characterization of clinical and environmental Salmonella strains // J. Clin. Microbiol. 2002. 40. (5). 1626–1635.Kotetishvili M., Stine O.C., Kreger A., Morris J.G.Jr., Sulakvelidze A. Multilocus sequence typing for characterization of clinical and environmental Salmonella strains // J. Clin. Microbiol. 2002. 40. (5). 1626–1635.Landeras E., Mendoza M.C. Evaluation of PCR-based methods and ribotyping performed with a mixture of PstI and SphI to differentiate strains of Salmonella serotype Enteritidis // J. Med. Microbiol. 1998. 47. (5). 427–434.Landeras E., Mendoza M.C. Evaluation of PCR-based methods and ribotyping performed with a mixture of PstI and SphI to differentiate strains of Salmonella serotype Enteritidis // J. Med. Microbiol. 1998. 47. (5). 427–434.Liebana E., Garcia-Migura L., Breslin M.F., Davies R.H., Woodward M.J. Diversity of strains of Salmonella enterica serotype enteritidis from English poultry farms assessed by multiple genetic fingerprinting // J. Clin. Microbiol. 2001. 39. (1). 154–161.Liebana E., Garcia-Migura L., Breslin M.F., Davies R.H., Woodward M.J. Diversity of strains of Salmonella enterica serotype enteritidis from English poultry farms assessed by multiple genetic fingerprinting // J. Clin. Microbiol. 2001. 39. (1). 154–161.Ramisse V., Houssu P., Hernandez E., Denoeud F., Hilaire V., Lisanti O., Ramisse F., Cavallo J.D., Vergnaud G. Variable number of tandem repeats in Salmonella enterica subsp. enterica for typing purposes // J. Clin. Microbiol. 2004. 42. (12). 5722–5730.Ramisse V., Houssu P., Hernandez E., Denoeud F., Hilaire V., Lisanti O., Ramisse F., Cavallo J.D., Vergnaud G. Variable number of tandem repeats in Salmonella enterica subsp. enterica for typing purposes // J. Clin. Microbiol. 2004. 42. (12). 5722–5730.Ridley A.M., Threlfall E.J., Rowe B. Genotypic characterization of Salmonella enteritidis phage types by plasmid analysis, ribotyping, and pulsed-field gel electrophoresis // J. Clin. Microbiol. 1998. 36. (8). 2314–2321.Ridley A.M., Threlfall E.J., Rowe B. Genotypic characterization of Salmonella enteritidis phage types by plasmid analysis, ribotyping, and pulsed-field gel electrophoresis // J. Clin. Microbiol. 1998. 36. (8). 2314–2321.Rivera M.J., Rivera A., Castillo J., Rubio M.C., Gomez-Lus R. Plasmid profile in epidemiological studies of human Salmonella infections // J. Chemother. 1993. 5. (Suppl. 1). 288–290.Rivera M.J., Rivera A., Castillo J., Rubio M.C., Gomez-Lus R. Plasmid profile in epidemiological studies of human Salmonella infections // J. Chemother. 1993. 5. (Suppl. 1). 288–290.Rychlik I., Karpiskova R., Faldynova M., Sisak F. Computer-assisted restriction endonuclease analysis of plasmid DNA in field strains of Salmonella enteritidis // Can. J. Microbiol. 1998. 44. (12). 1183–1185.Rychlik I., Karpiskova R., Faldynova M., Sisak F. Computer-assisted restriction endonuclease analysis of plasmid DNA in field strains of Salmonella enteritidis // Can. J. Microbiol. 1998. 44. (12). 1183–1185.Sajid S.U., Schwarz S. Plasmid fingerprinting and virulence gene detection among indigenous strains of Salmonella enterica serovar enteritidis // J. Ayub. Med. Coll. Abbottabad. 2009. 21. (2). 83–86.Sajid S.U., Schwarz S. Plasmid fingerprinting and virulence gene detection among indigenous strains of Salmonella enterica serovar enteritidis // J. Ayub. Med. Coll. Abbottabad. 2009. 21. (2). 83–86.Soto S.M., Guerra B., González-Hevia M.A., Mendoza M.C.. Potential of three-way randomly amplified polymorphic DNA analysis as a typing method for twelve Salmonella serotypes // Appl. Environ. Microbiol. 1999. 65. (11). 4830–4836.Soto S.M., Guerra B., González-Hevia M.A., Mendoza M.C.. Potential of three-way randomly amplified polymorphic DNA analysis as a typing method for twelve Salmonella serotypes // Appl. Environ. Microbiol. 1999. 65. (11). 4830–4836.Spratt B.G., Maiden M.C.J. Bacterial population genetics, evolution and epidemiology // Philos. Trans. R. Soc. Lond. B. Biol. Sci. 1999. 354. (1384). 701–710.Spratt B.G., Maiden M.C.J. Bacterial population genetics, evolution and epidemiology // Philos. Trans. R. Soc. Lond. B. Biol. Sci. 1999. 354. (1384). 701–710.Winokur P.L., Vonstein D.L., Hoffman L.J., Uhlenhopp E.K., Doern G.V. Evidence for transfer of CMY-2 AmpC beta-lactamase plasmids between Escherichia coli and Salmonella isolates from food animals and humans // Antimicrob. Agents Chemother. 2001. 45. (10). 2716–2722.Winokur P.L., Vonstein D.L., Hoffman L.J., Uhlenhopp E.K., Doern G.V. Evidence for transfer of CMY-2 AmpC beta-lactamase plasmids between Escherichia coli and Salmonella isolates from food animals and humans // Antimicrob. Agents Chemother. 2001. 45. (10). 2716–2722.Winokur P.L. Molecular epidemiological techniques for Salmonella strain discrimination // Front. Biosci. 2003. (8). c14–c24.Winokur P.L. Molecular epidemiological techniques for Salmonella strain discrimination // Front. Biosci. 2003. (8). c14–c24.

The authors declare that there are no conflicts of interest present.